El plan de estudios de Programa de Maestría en Riego y Drenaje se desarrolla en cuatro semestres (2 años) como mínimo y tres como máximo (3 años), durante los cuales el estudiante deberá cubrir 48 créditos y obtener el Grado de Magíster Scientiae, luego de la sustentación el trabajo de tesis correspondiente. El Plan de estudios tiene una estructura flexible que procura la participación conjunta de las entidades académicas que cultivan disciplinas o ramas afines, dentro y afuera de la Universidad Nacional Agraria La Molina.