El Jardín Botánico "Octavio Velarde Núñez" está ubicado en la Universidad Nacional Agraria La Molina, distrito de La Molina, provincia de Lima, Perú. Geográficamente está a 12º 05' 06" Latitud Sur y 76º 57' 00" Longitud Oeste, a 238 m.s.n.m. El clima presenta temperaturas mínimas mensuales promedio de 16.2 ºC y máximas de 22.5 ºC, una humedad relativa promedio anual de 81% y una precipitación total anual de 10 mm.
Dentro de la Universidad Nacional Agraria el Jardín Botánico está ubicado en la Av. Julio Gaudron, frente a la Oficina de Economía.