Misión de Educación
El Instituto de Biotecnología como parte de la Universidad Nacional Agraria La Molina, tiene la misión de desarrollar programas multidisciplinarios de educación para estudiantes universitarios, profesionales, agricultores e industriales, quienes impulsarán la biotecnología y ocuparán posiciones líderes dentro de la industria e instituciones académicas.

Misión de Investigación
El Instituto realiza investigaciones en el campo de cultivo de tejidos, ingeniería genética, biología molecular y celular, y otros campos afines en colaboración con los programas de investigación de la UNALM y otros instituciones públicas y privadas nacionales e internacionales.

Misión de Transferencia de Tecnología y Producción
El Instituto busca:
El desarrollo estratégico para la comercialización de los resultados obtenidos en los distintos programas, incluyendo alianzas estratégicas con instituciones e industrias para el desarrollo de tecnologías y productos de impacto comercial.
El desarrollo de un portafolio de técnicas y productos desarrollados, de aplicación inmediata para solucionar problemas de la industria agropecuaria.
El desarrollo de una transferencia de tecnología viable, que funcione eficientemente y garantice éxito para todas las partes.

Misión de Información
El Instituto informa su desarrollo tecnológico a través de las vías de comunicación como Internet y publicaciones científicas e industriales.
Además se desarrollará una colección de literatura especializada en cooperación con la Biblioteca Nacional Agraria y una base de datos.
El Instituto establecerá una base de datos para canalizar la investigación, información de técnicas de cultivo de las especies seleccionadas.

Misión de Alianzas Estratégicas
El Instituto establecerá importantes alianzas estratégicas con instituciones e industrias nacionales y extranjeras para el desarrollo de la educación, investigación, transferencia de tecnología e información.
Actualmente, el instituto cuenta con convenios de educación e investigación con las Universidades de Texas A & M, Rutgers de EE.UU. y Gembloux de Bélgica.

Misión de Defensa de los Recursos Naturales
El Perú tiene una riqueza natural de incalculable valor que necesita ser defendida, conservada y desarrollada. El Instituto coopera con los Institutos Regionales de la UNALM para establecer Bancos de Germoplasma Regionales usando técnicas de cultivo in vitro, criopreservación, y secuenciamiento de DNA.

Misión de Defensa del Medio Ambiente
El Instituto conciente de los problemas del medio ambiente colaborará con programas de reforestación, investigando el desarrollo de microorganismos que permitan la limpieza de tierras y aguas contaminadas, y desarrollando técnicas y productos que permitan la descontaminación del aire. El Instituto participará en la gestión del establecimiento de un Sistema de Bioseguridad con otras instituciones nacionales.

Misión de Protección de Invenciones Biotecnológicas
El Instituto colaborará con instituciones nacionales e internacionales para el desarrollo de un sistema de protección de invenciones a través de Patentes y Derechos de Productos Desarrollados y Procesos Inventados. Respetando acuerdos de Patentes, Secretos y Derechos Internacionales.