Además ha sido un fecundo investigador con varias publicaciones en las áreas de producción animal, reproducción animal y mejoramiento genético en camélidos y ovinos en diversas revistas científicas arbitradas de alto impacto.  Asimismo ha publicado libros referidos al mejoramiento de fibras de camélidos, y también obtuvo en el APPA ’91 Y APPA ’99 dos significativos premios a la investigación científica.

En el aspecto laboral ha ejercido la docencia en casas superiores de estudio como: la Universidad Nacional Federico Villarreal , la Universidad del Centro del Perú (Huancayo), y la Universidad Nacional de Huancavelica en la cual actualmente es profesor Principal en la cátedra de Mejoramiento Genético, estadística y Métodos estadístico en Universidad Nacional de Huancavelica y Vicerrector Administrativo de la misma.  Además ha sido consultor de la Universidad del Pacífico y ocupó la Jefatura del Programa de Ganadería de la estación Experimental de Satipo-Universidad Nacional de Huancavelica.

Es así que Quispe Peña, con una amplia trayectoria en diferentes ámbitos laborales y académicos presentó la tesis  “Estimación del Progreso genético de seis esquemas de selección en Alpacas (Vicugna pacos) Huacaya con tres modelos de evaluación en la región Alto andina de Huancavelica”, para optar el grado de Doctoris Philosophiae en el Programa Doctoral en Ciencia Animal.   

El presente trabajo de tesis se desarrolló considerando la población de alpacas Huacaya de color blanco de la región Huancavelica, con el objetivo principal de estimar el progreso genético y consanguinidad bajo diversos esquemas de selección planteados.  El mismo  que junto a los 210 graduados se luzca frente a las autoridades de esta casa de estudios al recibir tan alto cargo de egresado.